Родился он в 1966 году в городе Кемерово (Россия). Окончил Днепропетровский горный институт и Днепропетровский национальный университет. Кандидат экономических наук. Заслуженный экономист Украины.
В 1991-1996 годах прошел путь от государственного налогового инспектора до заместителя начальника налоговой инспекции Жовтневого района Днепропетровска.
В 1997-2005 годах возглавлял налоговые инспекции в Жовтневом и Бабушкинском районах города. С сентября 2006 до февраля 2008 года был председателем Государственной налоговой администрации в Днепропетровской области. И вот спустя два с лишним года Сергей Шинкаренко вновь занял это же кресло.
Кстати, с февраля 2008 до апреля 2010 года на должности председателя ГНА в Днепропетровской области работал Петр Васильевич Шинкаренко. В пресс-службе ГНА «Комсомолке» пояснили, что бывший и новый руководители не являются родственниками, а всего лишь однофамильцы.